Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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