Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.7 ms