Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXQ1Q9C009 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXQ1Q9C009 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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