Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms