Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FSCN1Q16658 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms