Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NCF4Q15080 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCF4Q15080 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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