Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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