Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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