Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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