Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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