Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHAF1AQ13111 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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