Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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