Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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