Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXF2Q12947 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXF2Q12947 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXF2Q12947 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXF2Q12947 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXF2Q12947 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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