Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FAM3AP98173 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms