Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ACTBP60709 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ACTBP60709 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ACTBP60709 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ACTBP60709 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ACTBP60709 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
ACTBP60709 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
ACTBP60709 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ACTBP60709 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ACTBP60709 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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