Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PLAA-201ENST00000397292 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 NCAM1-229ENST00000621518 4922 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CYP17A1-201ENST00000369887 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CLIP1-201ENST00000302528 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AL158206.1-201ENST00000563205 1965 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 WDR20-206ENST00000454394 2067 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MEF2C-229ENST00000627659 2393 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CDC42SE1-202ENST00000439374 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MYO7B-201ENST00000409090 3567 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PAX3-204ENST00000350526 3610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZNF17-206ENST00000601808 2524 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ANKUB1-201ENST00000446160 2419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 GNL2-201ENST00000373062 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC128688.2-201ENST00000563632 1937 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RTP3-201ENST00000296142 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CLDN16-201ENST00000264734 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SLC3A1-201ENST00000260649 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CCNJL-208ENST00000541762 2965 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 TRAF3IP2-201ENST00000340026 2785 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 LINC00562-201ENST00000566385 2470 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 FGD3-203ENST00000416701 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ANGPT4-201ENST00000381922 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC145285.2-201ENST00000507031 1963 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 NTRK3-220ENST00000626019 2741 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ACSL6-203ENST00000379240 2548 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MED7-201ENST00000286317 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 DCLRE1C-201ENST00000357717 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RNA5SP452-201ENST00000363004 119 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 AC245036.3-201ENST00000429259 146 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 AC018450.2-201ENST00000492307 368 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CTNNA2-214ENST00000496558 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC104063.1-201ENST00000504840 702 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 SNCA-211ENST00000508895 905 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CACNA1C-AS3-201ENST00000543559 444 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC025284.1-201ENST00000564358 579 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 LINC00595-209ENST00000634389 549 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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HOXD11P31277 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 COL4A4-201ENST00000396625 9895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CCDC40-204ENST00000397545 4294 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PSMD1-203ENST00000409643 2901 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 PIK3R5-209ENST00000581552 3253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AC004877.1-201ENST00000608963 4093 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MRPS11-201ENST00000325844 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 DDX11L9-201ENST00000559159 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ECD-201ENST00000372979 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 MORC1-201ENST00000232603 3764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 ZNF776-201ENST00000317178 5292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 AP001180.1-201ENST00000562202 3566 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 OR7A17-201ENST00000327462 1127 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RN7SKP246-201ENST00000364553 317 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HOXD11P31277 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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