Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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