Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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LRRIQ1Q96JM4 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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LRRIQ1Q96JM4 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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LRRIQ1Q96JM4 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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LRRIQ1Q96JM4 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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LRRIQ1Q96JM4 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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LRRIQ1Q96JM4 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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