Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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