Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TRAPPC2-201ENST00000359680 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC010332.1-201ENST00000620439 97 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 BRD7P2-201ENST00000466133 1944 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CORIN-205ENST00000504584 2417 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 PABPC4L-201ENST00000421491 4944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 KIAA1217-208ENST00000396446 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TCF4-207ENST00000540999 2572 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SPRY1-202ENST00000394339 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC021054.1-201ENST00000537514 2338 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GABRP-201ENST00000265294 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 BDNF-216ENST00000532997 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL662907.2-201ENST00000624339 3448 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 OR1G1-201ENST00000328890 998 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GBP5-201ENST00000370459 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms