Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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