Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 RIPOR2-202ENST00000378023 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 PDE1A-203ENST00000409365 2034 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 ZNF30-201ENST00000303586 2579 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 LINC01358-207ENST00000634502 2575 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 FHL1-206ENST00000394153 2374 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 ETV1-206ENST00000405218 3391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 KRT7-214ENST00000638501 398 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 TENM2-205ENST00000519204 9427 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 GNAI1-205ENST00000457358 1633 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 RBFOX1-223ENST00000620507 4018 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 RPL12P38-202ENST00000588627 2319 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC145207.5-201ENST00000582866 2682 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRHP20396 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
TRHP20396 LINC00210-201ENST00000431637 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC108451.1-201ENST00000558208 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 DNAH11-212ENST00000620169 13670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 SLC34A2-201ENST00000382051 4122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 LINC01929-201ENST00000589125 3067 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 LINC01692-201ENST00000441009 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 AC244102.1-201ENST00000437309 848 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 RNA5SP459-201ENST00000516628 100 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 PALLD-206ENST00000505667 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 AC132825.4-201ENST00000582527 3644 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 SLC30A8-202ENST00000456015 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 FGFR2-206ENST00000358487 4255 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRHP20396 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms