Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf172C9J069 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms