Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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TRIM35Q9UPQ4 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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TRIM35Q9UPQ4 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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TRIM35Q9UPQ4 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TRIM35Q9UPQ4 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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TRIM35Q9UPQ4 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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TRIM35Q9UPQ4 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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TRIM35Q9UPQ4 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TRIM35Q9UPQ4 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TRIM35Q9UPQ4 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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