Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA4CQ9C0C4 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA4CQ9C0C4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA4CQ9C0C4 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA4CQ9C0C4 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA4CQ9C0C4 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA4CQ9C0C4 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA4CQ9C0C4 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA4CQ9C0C4 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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