Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ARAFP3-201ENST00000454154 490 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 DMKN-219ENST00000461300 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 KCNAB1-AS2-201ENST00000473876 538 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 DMKN-239ENST00000474928 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 EGFLAM-AS1-201ENST00000508986 331 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ALDH1L1-AS1-201ENST00000512384 437 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP44-201ENST00000513513 1007 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP60-201ENST00000513846 995 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC233724.2-201ENST00000515727 271 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MSRA-205ENST00000518255 674 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 PIGFP1-201ENST00000519180 653 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-50-201ENST00000522107 317 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC008708.2-201ENST00000522956 1124 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SLC22A10-203ENST00000526800 699 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC007552.2-201ENST00000541892 603 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC016954.1-201ENST00000549976 745 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OAS1-211ENST00000553185 664 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SOD1P2-201ENST00000563903 451 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 IGHV1OR16-1-201ENST00000568055 392 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC090213.1-201ENST00000586841 546 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPIAP1-201ENST00000587900 742 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC010615.2-204ENST00000600469 830 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC027575.4-201ENST00000622010 586 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL589666.2-201ENST00000624603 618 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 STMND1-203ENST00000536551 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CRIP3-201ENST00000274990 800 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SNORD3G-201ENST00000362796 215 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 HSD17B7-203ENST00000367915 507 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FGGY-202ENST00000371210 1041 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL360268.2-201ENST00000414976 380 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPSAP26-201ENST00000442699 741 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms