Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ADAMTS9-AS2-204ENST00000485174 573 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL606804.1-202ENST00000446347 481 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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