Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PDCD1Q15116 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PDCD1Q15116 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PDCD1Q15116 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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