Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms