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| BRD3 | Q15059 | AC011476.3-202 | ENST00000586845 | 553 nt | TSL 3 BASIC | 6.19 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF208-204 | ENST00000599916 | 740 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.19 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC011500.1-201 | ENST00000601963 | 469 nt | BASIC | 6.19 | □□□□□ -1.42 | | |
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| BRD3 | Q15059 | ZNF624-201 | ENST00000311331 | 4241 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL391704.2-201 | ENST00000418379 | 981 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008173.1-201 | ENST00000418901 | 264 nt | BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | THEM7P-201 | ENST00000419556 | 672 nt | BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL359265.1-201 | ENST00000440296 | 795 nt | BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC113331.2-201 | ENST00000445557 | 926 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | XXYLT1-AS2-202 | ENST00000447975 | 784 nt | TSL 2 BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
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| BRD3 | Q15059 | ZNF227-208 | ENST00000589005 | 2943 nt | TSL 2 BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | PIGN-247 | ENST00000640540 | 4720 nt | TSL 5 BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF283-201 | ENST00000324461 | 2297 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTX3-204 | ENST00000617335 | 6155 nt | TSL 2 BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | SDAD1-203 | ENST00000395711 | 2513 nt | TSL 2 BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR9K1P-202 | ENST00000641111 | 3217 nt | BASIC | 6.18 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTCO1P18-201 | ENST00000455518 | 1419 nt | BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | LARP4-203 | ENST00000398473 | 6427 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | WDYHV1-208 | ENST00000523984 | 1491 nt | TSL 2 BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF615-201 | ENST00000376716 | 4048 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | GKN2-201 | ENST00000328895 | 800 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | TERB2-201 | ENST00000340827 | 1281 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | IGKV7-3-201 | ENST00000357453 | 298 nt | BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU105B-201 | ENST00000364478 | 208 nt | BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNA5SP91-201 | ENST00000390902 | 119 nt | BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-1176P-201 | ENST00000390955 | 107 nt | BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL035405.1-201 | ENST00000400795 | 710 nt | BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | AF178030.1-201 | ENST00000415088 | 402 nt | TSL 2 BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL159990.1-201 | ENST00000415119 | 337 nt | TSL 3 BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL121878.1-201 | ENST00000418638 | 859 nt | BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC018878.1-201 | ENST00000419904 | 433 nt | TSL 3 BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS15AP30-201 | ENST00000420976 | 390 nt | BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL162408.1-201 | ENST00000428853 | 433 nt | TSL 5 BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
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| BRD3 | Q15059 | FTH1P16-201 | ENST00000435241 | 552 nt | BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL159990.2-201 | ENST00000436491 | 337 nt | TSL 3 BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL096829.2-201 | ENST00000446582 | 742 nt | BASIC | 6.17 | □□□□□ -1.42 | | |