Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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