Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CBFBQ13951 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms