Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SRSF5Q13243 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms