Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms