Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF4Q08170 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms