Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NMBRP28336 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NMBRP28336 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms