Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA3Q9Y6H8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms