Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP16Q9Y5T5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms