Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms