Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms