Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms