Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms