Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms