Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSKSQ9UJT2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms