Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPXQ9UHP9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms