Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNTNAP2Q9UHC6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNTNAP2Q9UHC6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms