Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms