Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms