Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL20A1Q9P218 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms