Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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